Для сохранения чистосортности в одной теплице выращивают растения только одного сорта. Семенные плоды убирают красными и допускается дозаривание в течение 10 дней. Семена лучшего качества получают от плодов, сформированных на ветвях первых 3 порядков. Они дают более продуктивные растения. Использование плодов, сформированных позднее, приводит к снижению энергии прорастания до 38%, всхожести — до 69% и уменьшению урожая в потомстве на 7-20%. При дозаривании всхожесть и энергия прорастания увеличиваются. Выход семян сладкого перца составляет 0,9-1%. На семена используются нормально вызревшие плоды, со здоровых растений, отвечающие всем особенностям сорта. Если в холодный год семенники до заморозков не вызрели, то на семена можно убирать семенные кусты с вполне сформировавшимися плодами, достигшими фазы технической спелости или переходной от технической к биологической (семенной). Убранные кусты с недозревшими плодами прикапывают в парники, теплицы или развешивают в помещении с температурой не ниже 10°С для дозаривания плодов. Следует помнить, что семена из недозревших плодов (без дозаривания) имеют низкую полевую всхожесть и быстро теряют посевные качества.
Выбирают семена из плодов вручную, вырезая семяносцы с плодоножкой и частью околоплодника. Отдельные семена рассыпают тонким слоем на мешковине и сушат вначале на открытом воздухе в тени, а затем досушивают в сушильных камерах и термостатах при температуре 35-40°С в течение 1-2 ч до влажности не более 11%. Семена перца при хранении в сухом и прохладном месте сохраняют высокие посевные качества в течение 2-3 лет.
Сладкие сорта перцев, переопыленные острыми, дают горькие плоды. Поэтому рядом со сладкими сортами не следует высаживать перцы острых сортов.