Во время бонитировки у каракульских ягнят, оставленных на выращивание, выщипами на ушах отмечают смушковый тип, размер завитка, класс следующим образом: плоский смушковый тип — два выщипа на переднем крае правого уха; ребристый смушковый тип — два выщипа на переднем крае левого уха; размер завитка (только у черных ягнят) — выщипами на левом ухе: мелкий — один выщип спереди, средний — один выщип на конце, крупный — один выщип сзади.
Класс у всех чистопородных ягнят обозначают выщипом на правом ухе: элита — один выщип спереди и один выщип сзади, I класс — один выщип сзади, II класс — два выщипа сзади.
Оттенки серой окраски обозначают выщипами на левом ухе: светло-серый оттенок — один выщип спереди; средне-серый — один выщип на конце; темно-серый — один выщип сзади; голубая расцветка — дополнительно один выщип сзади на левом ухе; серебристая — один выщип спереди на левом ухе.
Кроме постоянного применяют временное мечение (при случке, ягнении, отборе, ветеринарных обработках и т.п.). Его проводят специальной краской «Овцевод». Эта краска удерживается на шерсти не менее месяца. Она не портит шерсть и легко смывается при мойке в горячем мыльно-содовом растворе на фабриках первичной обработки шерсти. Однако наличие даже такой краски на основной части руна не допускается. Поэтому временные метки лучше делать на голове и у корня хвоста или состригать окрашенные концы штапеля перед стрижкой.