Все коронавирусы продуцируют четыре основных структурных белка и несколько неструктурных белков. Тем не менее, большинство исследований SARS-CoV-2 на основе антител было сосредоточено на шипах и нуклеокапсидных белках. Исследование, опубликованное в журнале PLOS Biology Анной Хеффрон, Ирен Онг и коллегами из Университета Висконсин-Мэдисон, США, предполагает, что иммунные ответы могут развиваться против других белков, продуцируемых вирусом SARS-CoV-2.
Эффективность спайк- протеинавакцины на основе вариабельны, и не все инфицированные SARS-CoV-2 продуцируют обнаруживаемые антитела против белков-шипов или нуклеокапсидов. Следовательно, расширенные варианты на основе антител могут сыграть важную роль в улучшении вакцин, диагностических и терапевтических средств, особенно с учетом появления новых вариантов. Чтобы выяснить, вызывает ли инфекция SARS-CoV-2 устойчивые реакции антител против всех белков SARS-CoV-2, исследователи нанесли на карту 79 «эпитопов» — специфических областей вирусного протеома, которые распознают и связывают антитела. Они также проверили, могут ли антитела, которые развиваются в ответ на SARS-CoV-2 или существующие антитела от предыдущих воздействий коронавирусов, связываться с любым из белков шести других известных коронавирусов человека, чтобы идентифицировать потенциальные перекрестно-реактивные эпитопы.
Помимо белков-шипов и нуклеокапсидов, авторы обнаружили ранее неизвестные высокореактивные эпитопы В-клеток по всему спектру белков в SARS-CoV-2 и других коронавирусах, что расширило потенциал для будущих вакцин и терапевтических разработок. Однако необходимы дальнейшие исследования, чтобы определить, как долго остаются эти антитела и отличаются ли ответы вакцинированных лиц от тех, кто заразился COVID-19 до вакцинации. Доктор Онг и его коллеги продолжат изучение этих аспектов у взрослых и детей.
Хотя авторы прямо не описали варианты, вызывающие озабоченность, которые возникли с начала пандемии COVID-19, сравнение исходного генома SARS-CoV-2 с несколькими из вызывающих озабоченность вариантов выявило многочисленные вариации в регионах, которые находятся в или в пределах 3 аминокислот от идентифицированных связывающих антитело эпитопов.
По словам авторов: «Наше обширное профилирование реактивности антител, разрешающих эпитопы, у выздоравливающих пациентов с COVID-19, подтвержденное независимыми анализами, обеспечивает новые эпитопы, которые могут служить важными мишенями при разработке улучшенных диагностических средств, вакцин и терапевтических средств против SARS. -CoV-2, вызывающие озабоченность варианты и опасные человеческие коронавирусы, которые могут появиться в будущем ».
Источник: