Новый тест, который измеряет количество и качество неактивных вирусов ВИЧ в генах людей, живущих с ВИЧ, может в конечном итоге дать исследователям лучшее представление о том, какие лекарства лучше всего работают при лечении болезни.
В настоящее время не существует лекарств от ВИЧ и СПИДа, но антиретровирусные препараты, или АРТ, эффективно подавляют вирус до неопределяемого уровня.
В исследовании, опубликованном сегодня в журнале Cell Reports Medicine , обсуждается, как новый тест , разработанный совместно учеными Школы медицины Вашингтонского университета и Онкологическим исследовательским центром Фреда Хатчинсона, предоставит исследователям и, в конечном итоге, врачам более простой способ определить, сколько ВИЧ вирус может находиться в геноме пациента.
Этот латентный резервуар ВИЧ является результатом интеграции ВИЧ в ДНК, особенно в хромосомах Т-лимфоцитов и макрофагов, сказал доктор Флориан Хладик. Он является старшим автором статьи и профессором-исследователем в области акушерства и гинекологии из Университета штата Вашингтон. Он добавил, что интеграция вирусов в геном клетки-хозяина — уникальная особенность ретровирусов.
«Текущие тесты сложны, дороги и иногда дают неточные показания вирусной нагрузки», — сказал Хладик. Два существующих теста выполняются путем секвенирования вирусной ДНК из клеток пациента или индукции функционального роста вируса in vitro из культур клеток пациента. И то, и другое отнимает много времени и дорого, и их нелегко протестировать на новые лекарства-кандидаты от ВИЧ.
«Наш лабораторный тест — это более простой способ количественной оценки резервуара интактных вирусов», — сказал он.
Оценка новых методов лечения ВИЧ-инфекции основана на многократном измерении количества клеток, содержащих ДНК ВИЧ, до, во время и после лечения. Современные анализы не дают эту информацию достаточно быстро или с достаточной точностью, чтобы ее можно было использовать в будущих клинических испытаниях. А для некоторых анализов требуется несколько заборов крови от каждого пациента-субъекта.
Тест работает с использованием нового типа анализа, который использует преимущества мультиплексной способности капельной цифровой полимеразной цепной реакции (ddPCR). Он исследует каждую изолированную молекулу ДНК не только на наличие интегрированной ДНК ВИЧ, но и для определения того, является ли вирусная ДНК неповрежденной или дефектной. Для расчета количества Т-клеток, содержащих интактную ДНК ВИЧ, в геноме, используются коммерческое программное обеспечение и специальные анализы.
Источник: