Болезнь Альцгеймера с поздним началом (НАГРУЗКА) — наиболее распространенная форма деменции у пожилых людей, от которой страдают почти 44 миллиона человек во всем мире. Несмотря на десятилетия исследований, генетические факторы, предрасполагающие людей к НАГРУЗКЕ, до конца не изучены. В связи с ростом пожилого населения в США и многих других развитых странах существует острая необходимость в точных прогностических биомаркерах и эффективных вариантах лечения. Помимо пожилого возраста, варианты гена аполипопротеина E (APOE) являются сильным предиктором риска заболевания. Те, у кого есть вариант ε4, имеют более высокий риск развития болезни Альцгеймера, в то время как те, у кого другой вариант, ɛ2, обычно защищены. Удивительно, но многие люди не соблюдают эти правила — загадка, которая сбила с толку исследователей.
Используя новую методологию, исследователи из Медицинского колледжа Бейлора и Техасской детской больницы изучили геномы этих «нарушителей правил», что привело к идентификации 216 новых вариантов генов, многие из которых ранее не подозревали, что они играют роль в этом заболевании. Это захватывающий первый шаг к пониманию этого парадокса. Вновь идентифицированные биомаркеры потенциально могут быть использованы в будущем для уточнения оценки риска и прогноза пациентов в популяциях носителей APOEɛ2 и APOEɛ4 и выступать в качестве терапевтических мишеней для этого неизлечимого состояния.
Исследование, проведенное доктором. Оливье Лихтарж и Хуан Ботас, профессора молекулярной генетики и генетики человека в Медицинском колледже Бейлора и исследователи из Неврологического научно-исследовательского института Яна и Дэна Дунканов при Техасской детской больнице, были опубликованы в журнале « Болезнь Альцгеймера и деменция» .
«Мы хотели проверить, могут ли люди, демонстрирующие парадоксальные результаты, иметь другие генетические варианты, которые притупляют опасные или защитные эффекты генотипа APOE, который они несут», — сказал Лихтардж. «Для поиска этих вариантов Янг Вон Ким, аспирант моей лаборатории, разработал новые алгоритмы для сравнения и сопоставления генетических вариантов, присутствующих у каждого пациента. Затем нам повезло, что мы смогли протестировать их с помощью уникального высокопроизводительного фрукта. экран fly, разработанный Хуаном и его командой из Duncan NRI. Это хороший пример силы сравнительных исследований между видами, который возможен только при междисциплинарном сотрудничестве ».
Новый вычислительный подход находит 216 генов с дифференциальными вариантами в парадоксальных популяциях.
Широкий спектр клинических проявлений и сложных паттернов наследования НАГРУЗКИ, а также его совместное возникновение с другими невропатологиями, сердечными заболеваниями и возрастными когнитивными нарушениями являются одними из причин, по которым ученые обнаружили загадку парадоксальных пациентов с APOE 2 и ɛ4. особенно сложно.
В этом исследовании исследователи использовали самый большой набор данных экзома, доступный для этого состояния, который называется Проект определения последовательности болезни Альцгеймера (ADSP).
«Для скрининга потенциальных вариантов-кандидатов я сосредоточился на кодирующих областях генома человека и оценил функциональное влияние генетических вариантов, учитывая все прошлые эволюционные изменения в тех же положениях генов. С помощью серии регрессионных анализов мы обнаружили 216 гены со значительными различиями в мутационной нагрузке между двумя парадоксальными группами пациентов. Многие из этих генов показали участие в известных путях болезни Альцгеймера, таких как синаптическая биология, обрезка дендритных позвонков и воспалительные реакции в головном мозге. Кроме того, мы смогли использовать машинное обучение алгоритмы для прогнозирования того, какие носители APOEɛ4 останутся здоровыми, а у каких носителей APOE2 разовьется болезнь Альцгеймера на основе вариантов, которые они несут в 216 генах », — сказал ведущий автор исследования Янг Вон Ким.
Источник: