Плодоношение сиитаке наступает весной или осенью. Вначале появляются единичные плодовые тела, а затем они начинают расти группами по 20-30 штук на одном бревне. Оптимальная температура для плодоношения 12-20°С. При низкой температуре грибы растут медленно, а при высокой наблюдается удлинение ножки и уменьшение размеров шляпки. Весенний урожай сиитаке обычно обильнее осеннего, и грибы получаются лучшего качества. Плодоношение продолжается 4-6 лет. За этот период, например на древесине дуба, удается собрать с 1 м3 почти четверть тонны грибов. Уход за бревнами сводится к поливу и сбору грибов. Урожай за весь период культивирования составляет 10-20% от массы субстрата.
В природных условиях можно ускорить процесс созревания плодовых тел, применяя специальные приемы культивирования. Для стимуляции плодоношения обрубки замачивают в воде. После плодоношения их укрывают защитным воздухопроницаемым покрытием для стабилизации влажности и температуры. Через 1-2 месяца обрубки снова замачивают.